ביום 5 בדצמבר 2022, ניתן על ידי בית משפט השלום פסק דין בעניין ניסים פרג'ון מסחר 2000 בע"מ ואח' נ' מדינת ישראל אגף המכס ומע"מ, העוסק במערכת היחסים שבין רשות המכס, סוכן המכס והיבואנים אותם ייצג.
באותו עניין, היבואנים שילמו כספים לסוכן המכס בגין מיסי יבוא, סוכן המכס הגיע לחדלות פרעון והמסים לא שולמו בסופו של יום לרשות המכס. רשות המכס, דרשה מצדה את תשלום מיסי הייבוא מהיבואנים (חרף העובדה שהיבואנים שילמו את מיסי היבוא לסוכן המכס שהפסיק כאמור פעילות). היבואנים פנו לבית המשפט בתביעה כנגד רשות המכס, בטענה שזו התרשלה באי פיקוח על סוכן המכס, ועל כן עליה לספוג את עלות מיסי היבוא.
בית המשפט דחה את תביעות היבואנים ולמעשה, היבואנים נדרשו לשלם את מיסי היבוא פעמיים - פעם אחת לסוכן המכס שהפסיק פעילות ופעם שנייה לרשות המכס.
על פי פסק-הדין, נראה כי הדרך הטובה ביותר להימנע מאיבוד כספי המסים בתשלום לסוכן מכס שעשוי להפסיק את פעילותו, היא תשלום המסים באופן ישיר מהיבואן לרשות המכס, ללא מעבר דרך הסוכן, וזאת גם אם היבואן נעזר בסוכן מכס לצורך שחרור הטובין מפיקוח המכס.
